Firma MIKRONIKA funkcjonuje w ramach zintegrowanych systemów zarządzania jakością, środowiskiem i bhp PN-EN ISO 9001, PN-EN ISO 14001 i PN-ISO 45001.
Z uwagi na konieczność zapewnienia poufności, integralności i dostępności informacji, związanych z dostarczaniem rozwiązań systemowych został wdrożony System Zarządzania Bezpieczeństwem Informacji PN-ISO/IEC 27001 (SZBI).